目的 在全基因組范圍內篩選肝細胞癌候選診斷指標。方法 采用基因芯片技術比較40例肝細胞癌腫瘤標本及其鄰近無瘤肝組織之間基因表達譜的差異，尋找與肝細胞癌發生、發展相關的基因。基因芯片由美國國立衛生院癌癥研究所制定，每張芯片有9 984個點，含9 180個基因。基因芯片實驗采用雙色熒光直接標記法，每例患者的肝細胞癌組織總RNA 200 μg用綠色熒光素Cy5-dUTP標記，其相應的無瘤肝組織總RNA 100 μg用紅色熒光素Cy3-dUTP標記。混合后與芯片上的基因進行雜交。對基因芯片資料進行統計分析以尋找肝細胞癌組織與無瘤肝組織之間表達有差異的基因。結果 用非先導分層聚類分析法進行篩選，發現有10個基因在80%以上的肝細胞癌組織中的表達水平明顯高于（2倍或2倍以上）其相應的無瘤肝組織，包括ESTs、Homo sapiens cDNA FLJ、原鈣粘連素-α 9(protocadherinalpha 9)、KPNA2、RPS20、SNRPE、CDKN2A、UBD、MDK和ANXA2基因。這些基因與多種腫瘤相關，他們可能在肝細胞癌發生、發展過程中也發揮非常重要的作用。結論 進一步研究這些基因的功能可能篩選出新的肝細胞癌診斷指標。