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    • 非小細胞肺癌細胞 A549 順鉑耐藥潛在機制的全轉錄組測序分析

      目的通過全轉錄組測序分析比較野生型 A549 細胞和順鉑耐藥 A549 細胞(A549/DPP)表達譜的差別,揭示非小細胞肺癌(NSCLC)順鉑耐藥潛在機制。方法首先建立 A549/DDP 細胞系,對 A549 和 A549/DDP 進行全轉錄組測序,分別對 lncRNA-seq,circRNA-seq 和 miRNA-seq 數據進行差異表達以及功能富集分析(KEGG 和 GO 分析)。然后進行全轉錄組數據聯合分析以及 ceRNA 網絡的構建。結果與 A549 細胞系相比,其中 4 517 個 lncRNA、123 個 circRNA 以及 145 個 miRNA 在 A549/DDP 細胞中有差異表達。顯著富集在與癌癥相關的通路上。miRNA-circRNA-lncRNA-mRNA 四元網絡包含了 12 個 miRNA,4 個 circRNA,23 個 lncRNA 和 9 個 mRNA 節點。經過拓撲學性質分析 hsa-miR-125a-5p 和 hsa-miR-125b-5p 是順鉑耐藥相關的關鍵 miRNA。結論腫瘤壞死因子信號通路和 p53 信號通路參與了 A549/DPP 耐藥機制。Hsa-miR-125a-5p 和 hsa-miR-125b-5p 可能是逆轉順鉑抗性的潛在靶點。

      發表時間:2021-02-22 05:33 導出 下載 收藏 掃碼
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