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    • PSO+: 基于粒子群結合其他迭代算法非線性擬合熱對流聚合酶連鎖反應的熒光數據

      熱對流聚合酶連鎖反應(CCPCR)利用熱對流的原理,讓試劑在試管內流動,通過試管上下部分的溫度差來達到擴增目的。為了實時檢測擴增效果,我們在試劑體系中加入了熒光基團,通過熒光的強弱實時反映擴增的情況。實驗結果顯示熒光變化曲線符合擴增曲線的 S 型趨勢,但是由于熱對流的不穩定性而存在一定的抖動情況,不利于擴增循環閾值(CT 值)的計算。為了解決這個問題,本文采用動力學方法,利用雙 S 型函數模型來擬合曲線,使熒光曲線平滑,從而能更好地根據曲線來推斷核酸初始濃度,達到定量的目的。同時采用 PSO+算法求解雙 S 型函數參數,即用粒子群優化(PSO)算法結合 Levenberg-Marquardt、Newton-CG 等算法進行曲線擬合,有效克服 PSO 隨機性太強和傳統算法 Levenberg-Marquardt、Newton-CG 等容易陷入局部最優解的缺點,數據擬合結果的 R2 能夠達到 0.999 8。此研究對以后的實時熒光熱對流擴增的定量檢測研究有指導性意義。

      發表時間:2019-06-17 04:41 導出 下載 收藏 掃碼
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